オランダの東インド統治で領土は限定されたが、スラカルタ王国と共に最後まで自治領として認められる。

1755

　マタラーム王国の第３次ジャワ継承戦争(1749−1755)の結果、スラカルタの王（ススフーナン）とは別に、王族マンクー・ブーミがスルタン・ハメンク・ブウォノ１世としてジョクジャカルタに王朝を開く。
　ここにマタラーム王国はジョクジャカルタ王国とスラカルタ王国とに分裂、両国ともオランダの影響下に入った。

1813　　

　分家パクアラムが生じる。但し称号はスルタンより下の「パンゲラン（王子）」。

1825〜1830　　ジャワ戦争　　

　ジョクジャカルタ王国のスルタンの子ディポネゴロは反オランダ闘争に立ち上がるが鎮圧される。

第２次大戦後　　インドネシア共和国成立　　

　ジョクジャカルタ王国はもはや存在しないが、そのスルタン、ハメンク・ブウォノ９世はスカルノの独立闘争に協力、ジョクジャカルタ特別州の知事となり、第２次大戦後ジョクジャカルタは一時首都となった。

1973　　

　ハメンクブウォノ９世、スハルト政権の副大統領に就任。

1988　　

　ハメンクブウォノ10世即位。

　ジョクジャ王族へのインドネシア国民の敬愛は今も篤く、ハメンクブウォノ10世も２期連続で国民協議会議員に指名され、スハルト失脚後は、ハビビ大統領を次ぐ次期大統領候補の一人として名前が挙がっている。